MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 61141

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017167	GC	3	6	245532	245537	0 %	0 %	50 %	50 %	384134042
5002	NC_017167	TCT	2	6	245540	245545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384134042
5003	NC_017167	CACG	2	8	245546	245553	25 %	0 %	25 %	50 %	384134042
5004	NC_017167	CTT	2	6	245561	245566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384134042
5005	NC_017167	CGG	2	6	245612	245617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134042
5006	NC_017167	GC	3	6	245651	245656	0 %	0 %	50 %	50 %	384134042
5007	NC_017167	AGG	2	6	245662	245667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134042
5008	NC_017167	CGC	2	6	245668	245673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134042
5009	NC_017167	GC	3	6	245672	245677	0 %	0 %	50 %	50 %	384134042
5010	NC_017167	CAC	2	6	245706	245711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384134042
5011	NC_017167	GCG	2	6	245724	245729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134042
5012	NC_017167	CGC	2	6	245738	245743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134042
5013	NC_017167	TCG	2	6	245746	245751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134042
5014	NC_017167	TGCG	2	8	245777	245784	0 %	25 %	50 %	25 %	384134042
5015	NC_017167	GC	3	6	245811	245816	0 %	0 %	50 %	50 %	384134042
5016	NC_017167	GGC	3	9	245831	245839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134042
5017	NC_017167	GC	4	8	245843	245850	0 %	0 %	50 %	50 %	384134042
5018	NC_017167	CG	4	8	245871	245878	0 %	0 %	50 %	50 %	384134042
5019	NC_017167	G	7	7	245966	245972	0 %	0 %	100 %	0 %	384134042
5020	NC_017167	CTC	2	6	246027	246032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384134042
5021	NC_017167	GGA	2	6	246089	246094	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134042
5022	NC_017167	ACGA	2	8	246099	246106	50 %	0 %	25 %	25 %	384134042
5023	NC_017167	T	6	6	246117	246122	0 %	100 %	0 %	0 %	384134042
5024	NC_017167	CGTC	2	8	246131	246138	0 %	25 %	25 %	50 %	384134042
5025	NC_017167	GGT	2	6	246140	246145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134042
5026	NC_017167	GC	3	6	246158	246163	0 %	0 %	50 %	50 %	384134042
5027	NC_017167	CG	4	8	246172	246179	0 %	0 %	50 %	50 %	384134042
5028	NC_017167	GGA	2	6	246218	246223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134042
5029	NC_017167	GC	3	6	246243	246248	0 %	0 %	50 %	50 %	384134042
5030	NC_017167	GCG	2	6	246267	246272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134042
5031	NC_017167	CG	3	6	246271	246276	0 %	0 %	50 %	50 %	384134042
5032	NC_017167	GCC	2	6	246307	246312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134042
5033	NC_017167	CG	4	8	246374	246381	0 %	0 %	50 %	50 %	384134042
5034	NC_017167	CGC	2	6	246411	246416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134042
5035	NC_017167	GCG	3	9	246558	246566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134042
5036	NC_017167	AGGCG	2	10	246584	246593	20 %	0 %	60 %	20 %	384134042
5037	NC_017167	CGG	2	6	246606	246611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134042
5038	NC_017167	CCGC	2	8	246634	246641	0 %	0 %	25 %	75 %	384134042
5039	NC_017167	TGG	2	6	246654	246659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134042
5040	NC_017167	TGCC	2	8	246667	246674	0 %	25 %	25 %	50 %	384134042
5041	NC_017167	CGA	2	6	246709	246714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134042
5042	NC_017167	CGG	2	6	246734	246739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134042
5043	NC_017167	GC	3	6	246801	246806	0 %	0 %	50 %	50 %	384134042
5044	NC_017167	GC	3	6	246865	246870	0 %	0 %	50 %	50 %	384134042
5045	NC_017167	GCG	2	6	246880	246885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134042
5046	NC_017167	GCG	2	6	246918	246923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134042
5047	NC_017167	GC	4	8	246929	246936	0 %	0 %	50 %	50 %	384134042
5048	NC_017167	GCG	2	6	247123	247128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134043
5049	NC_017167	GTC	2	6	247215	247220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134043
5050	NC_017167	TCA	2	6	247274	247279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134043
5051	NC_017167	GGA	2	6	247284	247289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134043
5052	NC_017167	GAT	2	6	247332	247337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134043
5053	NC_017167	GGC	2	6	247347	247352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134043
5054	NC_017167	ACT	2	6	247415	247420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134043
5055	NC_017167	TCG	2	6	247448	247453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134043
5056	NC_017167	TTCA	2	8	247744	247751	25 %	50 %	0 %	25 %	384134044
5057	NC_017167	ACA	2	6	247868	247873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384134044
5058	NC_017167	CTT	2	6	247884	247889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384134044
5059	NC_017167	CTC	2	6	247951	247956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384134044
5060	NC_017167	GGT	2	6	247962	247967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134044
5061	NC_017167	GCG	2	6	248021	248026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134044
5062	NC_017167	GAG	2	6	248119	248124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134044
5063	NC_017167	GAG	2	6	248137	248142	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134044
5064	NC_017167	GC	4	8	248186	248193	0 %	0 %	50 %	50 %	384134044
5065	NC_017167	TGC	2	6	248207	248212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134044
5066	NC_017167	CTC	2	6	248242	248247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384134044
5067	NC_017167	GC	4	8	248248	248255	0 %	0 %	50 %	50 %	384134044
5068	NC_017167	GGCG	2	8	248259	248266	0 %	0 %	75 %	25 %	384134044
5069	NC_017167	TTC	2	6	248281	248286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384134044
5070	NC_017167	TCG	2	6	248306	248311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134044
5071	NC_017167	TCG	2	6	248318	248323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134044
5072	NC_017167	CG	3	6	248336	248341	0 %	0 %	50 %	50 %	384134044
5073	NC_017167	GAA	2	6	248364	248369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384134044
5074	NC_017167	CAT	2	6	248382	248387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134044
5075	NC_017167	CGA	2	6	248394	248399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134044
5076	NC_017167	CGCGG	2	10	248422	248431	0 %	0 %	60 %	40 %	384134044
5077	NC_017167	CGG	3	9	248436	248444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134044
5078	NC_017167	ACG	2	6	248447	248452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134044
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5080	NC_017167	TCA	2	6	248519	248524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134044
5081	NC_017167	CGC	2	6	248526	248531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134044
5082	NC_017167	GTC	2	6	248596	248601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134044
5083	NC_017167	GAG	2	6	248626	248631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134044
5084	NC_017167	CG	3	6	248646	248651	0 %	0 %	50 %	50 %	384134044
5085	NC_017167	ATC	2	6	248686	248691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134044
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5087	NC_017167	GCT	2	6	248751	248756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134044
5088	NC_017167	AAG	2	6	248767	248772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384134044
5089	NC_017167	CGA	2	6	248799	248804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134044
5090	NC_017167	ATCG	2	8	248809	248816	25 %	25 %	25 %	25 %	384134044
5091	NC_017167	TGA	2	6	248849	248854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134044
5092	NC_017167	TCG	2	6	248873	248878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134044
5093	NC_017167	GGT	2	6	248901	248906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134044
5094	NC_017167	CG	3	6	248957	248962	0 %	0 %	50 %	50 %	384134044
5095	NC_017167	CGG	2	6	248970	248975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134044
5096	NC_017167	AGC	2	6	249020	249025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134044
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5098	NC_017167	GGA	2	6	249069	249074	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134044
5099	NC_017167	GAT	2	6	249144	249149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134044
5100	NC_017167	CG	3	6	249199	249204	0 %	0 %	50 %	50 %	384134044
5101	NC_017167	CCT	2	6	249372	249377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384134044
5102	NC_017167	ATA	2	6	249640	249645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384134045
5103	NC_017167	AGT	2	6	249668	249673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134045
5104	NC_017167	CGC	2	6	249707	249712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134045
5105	NC_017167	GTT	2	6	249773	249778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384134045
5106	NC_017167	GCG	2	6	249809	249814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134045
5107	NC_017167	ACG	2	6	249820	249825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134045
5108	NC_017167	AACC	2	8	249893	249900	50 %	0 %	0 %	50 %	384134045
5109	NC_017167	GAC	2	6	250068	250073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134045
5110	NC_017167	CTCG	2	8	250209	250216	0 %	25 %	25 %	50 %	384134045
5111	NC_017167	CTGG	2	8	250350	250357	0 %	25 %	50 %	25 %	384134045
5112	NC_017167	TTG	2	6	250384	250389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384134045
5113	NC_017167	AGGTGA	2	12	250466	250477	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384134045
5114	NC_017167	GGTG	2	8	251109	251116	0 %	25 %	75 %	0 %	384134046
5115	NC_017167	CA	3	6	251119	251124	50 %	0 %	0 %	50 %	384134046
5116	NC_017167	CTG	2	6	251183	251188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134046
5117	NC_017167	GCGG	2	8	251245	251252	0 %	0 %	75 %	25 %	384134046
5118	NC_017167	GGA	2	6	251275	251280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134046
5119	NC_017167	GTG	2	6	251297	251302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134046
5120	NC_017167	GGT	2	6	251419	251424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134046
5121	NC_017167	GGA	2	6	251425	251430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134046
5122	NC_017167	CGA	2	6	251437	251442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134046
5123	NC_017167	GCG	3	9	251459	251467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134046
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5238	NC_017167	TCA	2	6	256253	256258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134053
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5240	NC_017167	TCG	2	6	256328	256333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134053
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5242	NC_017167	CGT	2	6	256533	256538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134053
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5244	NC_017167	CCG	2	6	256608	256613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134053
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5367	NC_017167	GACCT	2	10	268153	268162	20 %	20 %	20 %	40 %	384134061
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5370	NC_017167	CGT	2	6	268265	268270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134061
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5489	NC_017167	GCG	2	6	274125	274130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134066
5490	NC_017167	GGA	2	6	274137	274142	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134066
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5492	NC_017167	CTT	2	6	274192	274197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384134066
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